SMAD7

SMAD7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DJY, 2LTV, 2LTW, 2LTX, 2LTY, 2LTZ, 2KXQ
Ідентифікатори
Символи	SMAD7, CRCS3, MADH7, MADH8, SMAD family member 7
Зовнішні ІД	OMIM: 602932 MGI: 1100518 HomoloGene: 4314 GeneCards: SMAD7
Пов'язані генетичні захворювання
	колоректальний рак
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • beta-catenin binding; • type I transforming growth factor beta receptor binding; • зв'язування з колагеном; • I-SMAD binding; • activin binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • центросома; • регуляторний транскрипційний комплекс; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • катеніновий комплекс; • клітинне ядро; • fibrillar center; • гіалоплазма; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• cellular response to transforming growth factor beta stimulus; • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane depolarization; • pathway-restricted SMAD protein phosphorylation; • ureteric bud development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • adherens junction assembly; • positive regulation of cell-cell adhesion; • ventricular septum morphogenesis; • regulation of epithelial to mesenchymal transition; • negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation; • negative regulation of transcription by competitive promoter binding; • response to laminar fluid shear stress; • protein stabilization; • regulation of activin receptor signaling pathway; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • BMP signaling pathway; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation; • negative regulation of BMP signaling pathway; • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis; • negative regulation of protein ubiquitination; • negative regulation of cell migration; • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • artery morphogenesis; • negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • regulation of cardiac muscle contraction; • positive regulation of protein ubiquitination; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • ДНК-матрична транскрипція; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • protein deubiquitination; • negative regulation of T cell cytokine production; • negative regulation of T-helper 17 type immune response; • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation; • cellular response to leukemia inhibitory factor;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4092
	17131
	ENSG00000101665
	ENSMUSG00000025880
	O15105
	O35253
	NM_005904; NM_001190821; NM_001190822; NM_001190823
	NM_001042660; NM_008543
	NP_001177750; NP_001177751; NP_001177752; NP_005895
	NP_001036125
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMAD7 (англ. SMAD family member 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 46 426^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFRTKRSALV	RRLWRSRAPG	GEDEEEGAGG	GGGGGELRGE	GATDSRAHGA
GGGGPGRAGC	CLGKAVRGAK	GHHHPHPPAA	GAGAAGGAEA	DLKALTHSVL
KKLKERQLEL	LLQAVESRGG	TRTACLLLPG	RLDCRLGPGA	PAGAQPAQPP
SSYSLPLLLC	KVFRWPDLRH	SSEVKRLCCC	ESYGKINPEL	VCCNPHHLSR
LCELESPPPP	YSRYPMDFLK	PTADCPDAVP	SSAETGGTNY	LAPGGLSDSQ
LLLEPGDRSH	WCVVAYWEEK	TRVGRLYCVQ	EPSLDIFYDL	PQGNGFCLGQ
LNSDNKSQLV	QKVRSKIGCG	IQLTREVDGV	WVYNRSSYPI	FIKSATLDNP
DSRTLLVHKV	FPGFSIKAFD	YEKAYSLQRP	NDHEFMQQPW	TGFTVQISFV
KGWGQCYTRQ	FISSCPCWLE	VIFNSR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 doi:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 doi:10.1016/S1359-6101(99)00012-X
Lebrun J.J., Takabe K., Chen Y., Vale W. (1999). Roles of pathway-specific and inhibitory Smads in activin receptor signaling. Mol. Endocrinol. 13: 15—23. PMID 9892009 doi:10.1210/mend.13.1.0218
Wrana J.L., Attisano L. (2000). The Smad pathway. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 5—13. PMID 10708948 doi:10.1016/S1359-6101(99)00024-6
Miyazono K. (2000). TGF-beta signaling by Smad proteins. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 15—22. PMID 10708949 doi:10.1016/S1359-6101(99)00025-8