Перейти до вмісту

CACNA1E

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
CACNA1E
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CACNA1E, BII, CACH6, CACNL1A6, Cav2.3, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E, gm139, EIEE69, DEE69
Зовнішні ІД OMIM: 601013 MGI: 106217 HomoloGene: 20185 GeneCards: CACNA1E
Реагує на сполуку
bepridil hydrochloride monohydrate[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_000721
NM_001205293
NM_001205294
NM_009782
RefSeq (білок)
NP_000712
NP_001192222
NP_001192223
н/д
Локус (UCSC) Хр. 1: 181.32 – 181.81 Mb Хр. 1: 154.27 – 154.76 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CACNA1E (англ. Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 313 амінокислот, а молекулярна маса — 261 731[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MARFGEAVVA RPGSGDGDSD QSRNRQGTPV PASGQAAAYK QTKAQRARTM
ALYNPIPVRQ NCFTVNRSLF IFGEDNIVRK YAKKLIDWPP FEYMILATII
ANCIVLALEQ HLPEDDKTPM SRRLEKTEPY FIGIFCFEAG IKIVALGFIF
HKGSYLRNGW NVMDFIVVLS GILATAGTHF NTHVDLRTLR AVRVLRPLKL
VSGIPSLQIV LKSIMKAMVP LLQIGLLLFF AILMFAIIGL EFYSGKLHRA
CFMNNSGILE GFDPPHPCGV QGCPAGYECK DWIGPNDGIT QFDNILFAVL
TVFQCITMEG WTTVLYNTND ALGATWNWLY FIPLIIIGSF FVLNLVLGVL
SGEFAKERER VENRRAFMKL RRQQQIEREL NGYRAWIDKA EEVMLAEENK
NAGTSALEVL RRATIKRSRT EAMTRDSSDE HCVDISSVGT PLARASIKSA
KVDGVSYFRH KERLLRISIR HMVKSQVFYW IVLSLVALNT ACVAIVHHNQ
PQWLTHLLYY AEFLFLGLFL LEMSLKMYGM GPRLYFHSSF NCFDFGVTVG
SIFEVVWAIF RPGTSFGISV LRALRLLRIF KITKYWASLR NLVVSLMSSM
KSIISLLFLL FLFIVVFALL GMQLFGGRFN FNDGTPSANF DTFPAAIMTV
FQILTGEDWN EVMYNGIRSQ GGVSSGMWSA IYFIVLTLFG NYTLLNVFLA
IAVDNLANAQ ELTKDEQEEE EAFNQKHALQ KAKEVSPMSA PNMPSIERDR
RRRHHMSMWE PRSSHLRERR RRHHMSVWEQ RTSQLRKHMQ MSSQEALNRE
EAPTMNPLNP LNPLSSLNPL NAHPSLYRRP RAIEGLALGL ALEKFEEERI
SRGGSLKGDG GDRSSALDNQ RTPLSLGQRE PPWLARPCHG NCDPTQQEAG
GGEAVVTFED RARHRQSQRR SRHRRVRTEG KESSSASRSR SASQERSLDE
AMPTEGEKDH ELRGNHGAKE PTIQEERAQD LRRTNSLMVS RGSGLAGGLD
EADTPLVLPH PELEVGKHVV LTEQEPEGSS EQALLGNVQL DMGRVISQSE
PDLSCITANT DKATTESTSV TVAIPDVDPL VDSTVVHISN KTDGEASPLK
EAEIREDEEE VEKKKQKKEK RETGKAMVPH SSMFIFSTTN PIRRACHYIV
NLRYFEMCIL LVIAASSIAL AAEDPVLTNS ERNKVLRYFD YVFTGVFTFE
MVIKMIDQGL ILQDGSYFRD LWNILDFVVV VGALVAFALA NALGTNKGRD
IKTIKSLRVL RVLRPLKTIK RLPKLKAVFD CVVTSLKNVF NILIVYKLFM
FIFAVIAVQL FKGKFFYCTD SSKDTEKECI GNYVDHEKNK MEVKGREWKR
HEFHYDNIIW ALLTLFTVST GEGWPQVLQH SVDVTEEDRG PSRSNRMEMS
IFYVVYFVVF PFFFVNIFVA LIIITFQEQG DKMMEECSLE KNERACIDFA
ISAKPLTRYM PQNRHTFQYR VWHFVVSPSF EYTIMAMIAL NTVVLMMKYY
SAPCTYELAL KYLNIAFTMV FSLECVLKVI AFGFLNYFRD TWNIFDFITV
IGSITEIILT DSKLVNTSGF NMSFLKLFRA ARLIKLLRQG YTIRILLWTF
VQSFKALPYV CLLIAMLFFI YAIIGMQVFG NIKLDEESHI NRHNNFRSFF
GSLMLLFRSA TGEAWQEIML SCLGEKGCEP DTTAPSGQNE NERCGTDLAY
VYFVSFIFFC SFLMLNLFVA VIMDNFEYLT RDSSILGPHH LDEFVRVWAE
YDRAACGRIH YTEMYEMLTL MSPPLGLGKR CPSKVAYKRL VLMNMPVAED
MTVHFTSTLM ALIRTALDIK IAKGGADRQQ LDSELQKETL AIWPHLSQKM
LDLLVPMPKA SDLTVGKIYA AMMIMDYYKQ SKVKKQRQQL EEQKNAPMFQ
RMEPSSLPQE IIANAKALPY LQQDPVSGLS GRSGYPSMSP LSPQDIFQLA
CMDPADDGQF QERQSLEPEV SELKSVQPSN HGIYLPSDTQ EHAGSGRASS
MPRLTVDPQV VTDPSSMRRS FSTIRDKRSN SSWLEEFSME RSSENTYKSR
RRSYHSSLRL SAHRLNSDSG HKSDTHRSGG RERGRSKERK HLLSPDVSRC
NSEERGTQAD WESPERRQSR SPSEGRSQTP NRQGTGSLSE SSIPSVSDTS
TPRRSRRQLP PVPPKPRPLL SYSSLIRHAG SISPPADGSE EGSPLTSQAL
ESNNACLTES SNSPHPQQSQ HASPQRYISE PYLALHEDSH ASDCGEEETL
TFEAAVATSL GRSNTIGSAP PLRHSWQMPN GHYRRRRRGG PGPGMMCGAV
NNLLSDTEED DKC

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

[ред. | ред. код]
  • Mori M.X., Vander Kooi C.W., Leahy D.J., Yue D.T. (2008). Crystal structure of the CaV2 IQ domain in complex with Ca2+/calmodulin: high-resolution mechanistic implications for channel regulation by Ca2+. Structure. 16: 607—620. PMID 18400181 doi:10.1016/j.str.2008.01.011

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1392 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q15878 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]