Han malte scener fra Bibelen i naturalistisk stil. Da forsøkte han å få bildene til å se ut slik det er i virkeligheten. Caravaggio var en av de første som malte religiøse bilder på denne måten.
I bildene hans var det sterke forskjeller mellom lys og mørke. Teknikken han brukte kalles chiaroscuro.
Det finnes trolig mellom 40 og 80 bilder malt av Caravaggio. Tallet er usikkert fordi man ikke alltid vet hvem kunstneren er.